Výskumné záujmy
Používame nástroje syntetickej biológie na vytvorenie nových stratégií genetického inžinierstva na výrobu produktov s pridanou hodnotou, najmä jednobunkových olejov, v rôznych kvasinkách (napr. Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Yarrowia lipolytica a Rhodosporidium toruloides). Jednobunkové oleje majú potenciál spĺňať špecifické požiadavky trhu z hľadiska zloženia a fyzikálno-chemických vlastností. Výroba jednobunkového oleja je v súlade so zásadami udržateľnej a ekologickej biotechnológie a ponúka potenciálne riešenia pre výživové a energetické potreby. Pochopenie homeostázy metabolizmu neutrálnych lipidov je kľúčové pre akumuláciu jednobunkového oleja uloženého v lipidových kvapkách. Preto je aj tento aspekt v rozsahu nášho výskumného záujmu. Okrem toho aktívne skúmame nové obranné mechanizmy, ktoré chránia kvasinkové bunky pred toxicitou nahromadených hodnotných lipidov. Vzhľadom na priamu súvislosť medzi lipotoxicitou u ľudí a patologickými dôsledkami vnútrobunkovej akumulácie lipidov sú tieto zistenia prísľubom pre potenciálne biomedicínske aplikácie.
Spolupracujeme aj s ďalšími domácimi a zahraničnými laboratóriami. Viac informácií nájdete v našich publikáciách.
Zoznam pracovníkov
Mgr. Roman Holič, PhD. – vedúci skupiny
Mgr. Martina Garaiová, PhD.
Mgr. Kristína Alföldiová – doktorandka
Mgr. Marek Lúčan – doktorand
Allumni
Mgr. Daniela Krajčiová – PhD. práca
Mgr. Marek Lúčan – Mgr. práca
Mgr. Marek Lúčan – Mgr. práca
Mgr. Nikoleta Šulaková – Mgr. práca
Ing. Bálint Czíferi – Ing. práca
Ing. Simoneta Holocsiová – Bc. a Ing. práce
Ing. Gabriela Jeleňová – Bc. a Ing. práce
Ing. Peter Seč – PhD. práca
Vybrané publikácie
- KRAJČIOVÁ, Daniela – HOLIČ, Roman. The Plasma Membrane H+-ATPase Promoter Driving the Expression of FADX Enables Highly Efficient Production of Punicic Acid in Rhodotorula toruloides Cultivated on Glucose and Crude Glycerol. In Journal of Fungi, 2024, vol. 10, no. 9, art. no. 649.
- GARAIOVÁ, Martina – DING, Yunfeng* – HOLIČ, Roman – VALACHOVIČ, Martin – ZHANG, Congyan – HAPALA, Ivan – LIU, Pingsheng. Yeast perilipin Pet10p/Pln1p interacts with Erg6p in ergosterol metabolism. In Biochimica et Biophysica Acta – Molecular and Cell Biology of Lipids, 2024, vol. 1869, no. 6, art. no. 159506.
- URBANÍKOVÁ, Veronika – PARK, Young-Kyoung – KRAJČIOVÁ, Daniela – TACHEKORT, Mehdi – ČERTÍK, Milan – GRIGORAS, Ioana – HOLIČ, Roman – NICAUD, J.M. – GAJDOŠ, Peter. Yarrowia lipolytica as a Platform for Punicic Acid Production. In International Journal of Molecular Sciences, 2023, vol. 24, no. 10, art. no. 8823.
- GARAIOVÁ, Martina – HUA, Qiang – HOLIČ, Roman. Heterologous Production of Calendic Acid Naturally Found in Calendula officinalis by Recombinant Fission Yeast. In Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2023, vol. 71, no. 8, p. 3842-3851.
- HOLIČ, Roman – ŠŤASTNÝ, Dominik – GRIAČ, Peter. Sec14 family of lipid transfer proteins in yeasts. In Biochimica et Biophysica Acta – Molecular and Cell Biology of Lipids, 2021, vol. 1866, no. 10, art. no. 158990.
- WANG, Juli – XU, Yang – HOLIČ, Roman – YU, Xiaochen – SINGER, Stacy D. – CHEN, Guanqun. Improving the Production of Punicic Acid in Baker’s Yeast by Engineering Genes in Acyl Channeling Processes and Adjusting Precursor Supply. In Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2021, vol. 69, no. 33, p. 9616-9624.
- HAPALA, Ivan – GRIAČ, Peter – HOLIČ, Roman. Metabolism of Storage Lipids and the Role of Lipid Droplets in the Yeast Schizosaccharomyces pombe. In Lipids, 2020, vol. 55, iss. 5, p. 513-535.
- HOLIČ, Roman – POKORNÁ, Lucia – GRIAČ, Peter. Metabolism of phospholipids in the yeast Schizosaccharomyces pombe. In Yeast, 2020, vol. 37, iss. 1, p. 73-92.
- XU, Yang – CALDO, Kristian Mark P. – HOLIČ, Roman – MIETKIEWSKA, Elzbieta – OZGA, Jocelyn – RIZVI, Syed Masood – CHEN, Guanqun – WESELAKE, Randall J.. Engineering Arabidopsis long-chain acyl-CoA synthetase 9 variants with enhanced enzyme activity. In Biochemical Journal, 2019, vol. 476, no. 1, p. 151-164.
- HOLIČ, Roman – XU, Yang – CALDO, Kristian Mark P. – SINGER, Stacy D. – FIELD, Catherine J. – WESELAKE, Randall J. – CHEN, Guanqun. Bioactivity and biotechnological production of punicic acid. In Applied Microbiology and Biotechnology, 2018, vol. 102, iss. 8, p. 3537-3549.
- XU, Yang – HOLIČ, Roman – LI, Darren – PAN, Xue – MIETKIEWSKA, Elzbieta – CHEN, Guanqun – OZGA, Jocelyn – WESELAKE, Randall J.. Substrate preferences of long-chain acyl-CoA synthetase and diacylglycerol acyltransferase contribute to enrichment of flax seed oil with alpha-linolenic acid. In Biochemical Journal, 2018, vol. 475, p. 1473-1489.
- GARAIOVÁ, Martina – MIETKIEWSKA, Elzbieta – WESELAKE, Randall J. – HOLIČ, Roman. Metabolic engineering of Schizosaccharomyces pombe to produce punicic acid, a conjugated fatty acid with nutraceutic properties. In Applied Microbiology and Biotechnology, 2017, vol. 101, no. 21, pp. 7913-7922.
- VALACHOVIČ, Martin – GARAIOVÁ, Martina – HOLIČ, Roman – HAPALA, Ivan. Squalene is lipotoxic to yeast cells defective in lipid droplet biogenesis. In Biochemical and biophysical research communications, 2016, vol. 469, p. 1123-8.
- SEČ, Peter – GARAIOVÁ, Martina – GAJDOŠ, Peter – ČERTÍK, Milan – GRIAČ, Peter – HAPALA, Ivan – HOLIČ, Roman. Baker’s Yeast Deficient in Storage Lipid Synthesis Uses cis-Vaccenic Acid to Reduce Unsaturated Fatty Acid Toxicity. In Lipids, 2015, vol. 50, no. 7, p. 621-630.